Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP1Q9NZU7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms