Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms