Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms