Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms