Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms