Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms