Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
DUOX2Q9NRD8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DUOX2Q9NRD8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DUOX2Q9NRD8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DUOX2Q9NRD8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DUOX2Q9NRD8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms