Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASS4Q9NQ75 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms