Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms