Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms