Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms