Protein–RNA interactions for Protein: Q9H444

CHMP4B, Charged multivesicular body protein 4b, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BQ9H444 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BQ9H444 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms