Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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