Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms