Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms