Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYT17Q9BSW7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms