Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms