Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDF4Q9BRK5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms