Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms