Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms