Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms