Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms