Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN2AQ99865 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms