Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms