Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3IPQ96QF0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms