Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms