Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms