Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms