Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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C9orf85Q96MD7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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C9orf85Q96MD7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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C9orf85Q96MD7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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C9orf85Q96MD7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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