Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms