Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms