Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms