Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC97Q96F63 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms