Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.844e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 LIFR-205ENST00000506990 760 ntTSL 320.27■□□□□ 0.844e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.833e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 RASSF4-211ENST00000489171 4350 ntTSL 1 (best)20.22■□□□□ 0.833e-14■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 SYT7-210ENST00000545053 578 ntTSL 220.21■□□□□ 0.834e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 SERTAD2-202ENST00000476805 1068 ntTSL 319.79■□□□□ 0.764e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.743e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.744e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.744e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.724e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.74e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 LIFR-208ENST00000511561 574 ntTSL 419.24■□□□□ 0.674e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.674e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.644e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 D2HGDH-208ENST00000445308 955 ntTSL 219.05■□□□□ 0.644e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.624e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-225ENST00000464894 754 ntTSL 518.74■□□□□ 0.594e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.584e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DCAF5-204ENST00000553943 736 ntTSL 318.65■□□□□ 0.584e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 TEX261-202ENST00000433258 758 ntTSL 218.61■□□□□ 0.574e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.544e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PRPF40B-208ENST00000548436 2059 ntTSL 218.3■□□□□ 0.524e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-261ENST00000498593 609 ntTSL 218.22■□□□□ 0.514e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.514e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 D2HGDH-206ENST00000436747 4549 ntTSL 1 (best)18.04■□□□□ 0.484e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-217ENST00000460051 630 ntTSL 1 (best)17.97■□□□□ 0.474e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-235ENST00000471786 751 ntTSL 317.97■□□□□ 0.474e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.464e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.454e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.444e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.443e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 D2HGDH-213ENST00000470343 1026 ntTSL 1 (best)17.74■□□□□ 0.434e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 SYT7-204ENST00000539246 1961 ntTSL 517.7■□□□□ 0.424e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.424e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.424e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.414e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 TEX261-203ENST00000466731 585 ntTSL 1 (best)17.62■□□□□ 0.414e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.374e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.374e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.374e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 JMJD8-204ENST00000563088 1067 ntTSL 317.34■□□□□ 0.374e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.374e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PRPF40B-215ENST00000551418 583 ntTSL 517.23■□□□□ 0.354e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 ITGB5-207ENST00000481591 1202 ntTSL 517.23■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.354e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 LARGE1-210ENST00000434071 562 ntTSL 417.18■□□□□ 0.344e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DHX16-203ENST00000415603 892 ntTSL 317.15■□□□□ 0.344e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 NELFCD-202ENST00000464363 764 ntTSL 217.1■□□□□ 0.334e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.324e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.294e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 L3MBTL4-205ENST00000580162 457 ntTSL 316.85■□□□□ 0.294e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.264e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.264e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PPFIBP2-223ENST00000532926 1597 ntTSL 216.63■□□□□ 0.254e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 LARGE1-213ENST00000494763 537 ntTSL 416.2■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 AC004890.2-203ENST00000481817 943 ntTSL 216.17■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-226ENST00000465927 893 ntTSL 316.13■□□□□ 0.174e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.164e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 BRF1-208ENST00000546997 1999 ntTSL 216.05■□□□□ 0.164e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.154e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.154e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.144e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.144e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.134e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 TLE1-204ENST00000418319 936 ntTSL 515.86■□□□□ 0.134e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.124e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.124e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-255ENST00000490622 1579 ntTSL 215.81■□□□□ 0.124e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 NELFCD-203ENST00000471621 902 ntTSL 215.72■□□□□ 0.114e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.14e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.094e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 LARGE1-208ENST00000430220 559 ntTSL 415.59■□□□□ 0.094e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.084e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-249ENST00000486450 583 ntTSL 315.52■□□□□ 0.084e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PPP6R3-217ENST00000529344 603 ntTSL 415.42■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PPP6R3-215ENST00000528635 538 ntTSL 415.42■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.054e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DDB1-216ENST00000539739 1624 ntTSL 515.34■□□□□ 0.057e-10■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DDB1-218ENST00000540784 1119 ntTSL 315.33■□□□□ 0.047e-10■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 C9orf3-217ENST00000479161 942 ntTSL 515.23■□□□□ 0.031e-8■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.024e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 RASSF4-202ENST00000427758 528 ntTSL 315.15■□□□□ 0.023e-14■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.014e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.014e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 LARGE1-204ENST00000413114 773 ntTSL 415.12■□□□□ 0.014e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -04e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.014e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.034e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 AK4-204ENST00000474968 928 ntTSL 214.85□□□□□ -0.034e-6■■■■■ 41.2
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