Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms