Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
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