Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
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RABGGTAQ92696 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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RABGGTAQ92696 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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RABGGTAQ92696 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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RABGGTAQ92696 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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RABGGTAQ92696 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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RABGGTAQ92696 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABGGTAQ92696 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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