Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms