Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPDL3BQ92485 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPDL3BQ92485 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPDL3BQ92485 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPDL3BQ92485 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPDL3BQ92485 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPDL3BQ92485 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPDL3BQ92485 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPDL3BQ92485 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPDL3BQ92485 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPDL3BQ92485 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPDL3BQ92485 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPDL3BQ92485 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPDL3BQ92485 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPDL3BQ92485 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPDL3BQ92485 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPDL3BQ92485 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPDL3BQ92485 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPDL3BQ92485 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPDL3BQ92485 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPDL3BQ92485 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPDL3BQ92485 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms