Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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C11orf40Q8WZ69 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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C11orf40Q8WZ69 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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C11orf40Q8WZ69 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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C11orf40Q8WZ69 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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C11orf40Q8WZ69 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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C11orf40Q8WZ69 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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C11orf40Q8WZ69 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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C11orf40Q8WZ69 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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C11orf40Q8WZ69 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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C11orf40Q8WZ69 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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C11orf40Q8WZ69 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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C11orf40Q8WZ69 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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C11orf40Q8WZ69 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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C11orf40Q8WZ69 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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C11orf40Q8WZ69 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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C11orf40Q8WZ69 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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C11orf40Q8WZ69 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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