Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms