Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms