Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms