Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC4Q8N9L1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms