Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX3Q8N9I9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms