Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms