Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4U5

TCP11L2, T-complex protein 11-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L2Q8N4U5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCP11L2Q8N4U5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TCP11L2Q8N4U5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms