Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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