Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC6Q8IVU3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms