Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMB4Q86W47 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms